孔雀鱼的染色体共有48条，雄雌鱼表示如下：
雄： 2N＝48＝46＋XY
雌： 2N＝48＝46＋XX
其中46条为体染色体，XY（或XX）为性染色体。
一，有一类基因是通过46条中的体染色体遗传给后代的，这一类遗传包括：白子、真红眼、黄化......等等，就是原文中称作“体染色体隐性遗传基因E” 这一类型的基因，它们的共同特点是，带有这个基因表现的小鱼，一下生就带有这个特征表现，例如，黄化种的小鱼下生时就已经是黄色的了。但由于这类基因是隐性基因，所以小鱼必须同时从父母那里都继承了这个基因，才会出现这种体色，如果只继承了父母一方的这个基因，则不会有这个体色的表现。而只会隐含这个基因，故称“隐性基因”，还以黄化（表示为gg）为例：
1，若父母鱼都是黄化体表现，则：
雄亲鱼：g g
雌亲鱼：g g
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F1仔鱼：gg gg 结果小鱼都是黄化体
2,若雄亲鱼是黄化体表现，雌鱼是普通体的（反之亦然），则：
雄亲鱼：g g
雌亲鱼：G G （G表示和g在同一个位置上的普通体染色体）
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F1仔鱼：gG gG 结果小鱼全都是带有黄化基因，但体色表现是普通体的鱼）
3,若雄亲鱼同2，而雌亲鱼是带有黄化基因，但体色表现是普通体的鱼（即gG），则：
雄亲鱼：g g
雌亲鱼：g G
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F1仔鱼：gg gG 结果小鱼里面有一半有黄化的表现，另一半带基因但无表现
4,若雄亲鱼是带黄化基因但无表现的（gG），雌亲鱼同2的情况，则：
雄亲鱼：g G
雌亲鱼：G G
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F1仔鱼：gG，GG GG，gG 结果小鱼有一半带黄化基因，但体色表现全是普通体。
第4种情况是产生表现的最差的一种情况，但我们在延续某一个基因的时候却最常用，例如我们侥幸买到一条黄化孔雀（gg），但只有一条，如何才能延续黄化这个基因呢？办法就是找一条没有黄化基因，但所带的其它基因比较理想的鱼来配种，当繁殖到第二代（F2）的时候，就会出现约1/16的黄化小鱼了。以上分析可以看出，从一条黄化孔雀开始，可以培养出整窝的黄化孔雀鱼，但过程较长，饲养群体较庞大
孔雀鱼杂交公式 扩展
孔雀鱼的种类比较多，各个种类杂交繁衍的小鱼都会产生不同的颜色，以下是常见的几款孔雀鱼繁殖的种类：
霓红礼服+德系黄尾礼服1次=天空蓝礼服
蓝草尾+德系黄尾服2次=天空蓝礼服
蛇王+马赛克2次=马赛克蛇王
蛇王+白子红尾3次=白子红尾蛇王
古老品系扇尾+马赛克2次=古老品系马赛克
珊瑚双剑+马赛克3次=珊瑚马赛克
珊瑚双剑+白子红尾2次=白子珊瑚红尾
日本蓝芦圣德+马赛克3次=日本蓝马赛克
日本蓝芦圣德+蓝草尾4次=日本蓝草尾
白金双剑+ 马赛克3次=白金马赛克
白金双剑+德系黄尾礼服4次=白金德系黄尾礼服
金属蛇王+马赛克2次=金属莫斯科蓝
全金属马赛克+蓝草尾4=金属蓝草尾
